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Consistent Treatment of Hydrophobicity in Protein Lattice Models Accounts for Cold Denaturation

机译:蛋白质格子模型中疏水性的一致处理可解释冷变性

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摘要

The hydrophobic effect stabilizes the native structure of proteins by minimizing the unfavorable interactions between hydrophobic residues and water through the formation of a hydrophobic core. Here, we include the entropic and enthalpic contributions of the hydrophobic effect explicitly in an implicit solvent model. This allows us to capture two important effects: a length-scale dependence and a temperature dependence for the solvation of a hydrophobic particle. This consistent treatment of the hydrophobic effect explains cold denaturation and heat capacity measurements of solvated proteins.
机译:疏水作用通过最小化疏水残基与水之间的不利相互作用(通过形成疏水核)来稳定蛋白质的天然结构。在这里,我们在隐式溶剂模型中明确包括了疏水作用的熵和焓贡献。这使我们能够捕获两个重要的影响:疏水性粒子的溶剂化的长度比例依赖性和温度依赖性。这种对疏水作用的一致处理解释了溶剂化蛋白质的冷变性和热容测量。

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